Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms