Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Foxd1Q61345 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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