Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms