Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms