Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms