Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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