Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms