Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spag9Q58A65 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spag9Q58A65 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms