Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Urb1Q571H0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms