Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms