Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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