Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms