Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc110Q3V125 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms