Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dnah12Q3V0Q1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms