Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms