Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Usp48Q3V0C5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp48Q3V0C5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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