Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933416C03RikQ3V063 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933416C03RikQ3V063 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms