Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C87499Q3UX49 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms