Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms