Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms