Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms