Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E330014E10RikQ3UL33 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms