Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms