Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms