Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms