Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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