Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms