Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm2Q3TWN3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms