Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms