Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms