Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms