Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms