Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms