Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Specc1lQ2KN98 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Specc1lQ2KN98 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms