Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam178bQ24JP3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms