Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Samd11Q1RNF8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd11Q1RNF8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms