Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cpne9Q1RLL3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cpne9Q1RLL3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cpne9Q1RLL3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cpne9Q1RLL3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cpne9Q1RLL3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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