Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms