Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms