Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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