Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms