Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pglyrp4Q0VB07 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms