Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms