Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SobpQ0P5V2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms