Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms