Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms