Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms