Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cab39Q06138 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cab39Q06138 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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