Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top1Q04750 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top1Q04750 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms