Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms